Ústavy
- Geografický ústav
- Národní centrum pro výzkum biomolekul
- RECETOX
- Ústav antropologie
- Ústav biochemie
- Ústav botaniky a zoologie
- Ústav experimentální biologie
- Ústav fyziky a technologií plazmatu
- Ústav fyziky kondenzovaných látek
- Ústav geologických věd
- Ústav chemie
- Ústav matematiky a statistiky
- Ústav teoretické fyziky a astrofyziky